監(jiān)測人員應(yīng)根據(jù)具體情況確定挑選出對解決問題最關(guān)鍵的指標，這樣不僅能較快的解決實際問題，而且能更合理地使用人力和經(jīng)費。在選擇監(jiān)測指標時，一般應(yīng)遵循以下原則。

1．根據(jù)監(jiān)測目的的選擇監(jiān)測指標

例如，若要及時發(fā)現(xiàn)早期污染，可選擇對低濃度污染物敏感的動物行為反應(yīng)或植物傷斑等易于觀測的指標。若要監(jiān)測環(huán)境污染程度，可采用植物化學(xué)分析方法直接測定監(jiān)測植物體內(nèi)污染物的蓄積量。防空智能核生化控制中心的使用人防BK-RF037分析樹木年輪性狀可揭示當?shù)匚廴練v史等等。

2．根據(jù)污染物的性質(zhì)和毒理作用機制選擇監(jiān)測指標

不同性質(zhì)的污染物其毒理作用機制不同，會產(chǎn)生不同的毒性效應(yīng)。例如，有些污染物能抑制光合作用，或抑制呼吸作用。選擇光合效率或呼吸速率作為監(jiān)測指標就能達到監(jiān)測這些污染物的目的。防空智能核生化控制中心的使用人防BK-RF037又如，有些污染物能刺激超氧化物岐化酶、過氧化氫酶及過氧化物酶活性，這些酶的活性就是有用的監(jiān)測指標。

3．根據(jù)生物的特性選擇監(jiān)測指標

監(jiān)測生物可以是動物、植物或微生物；在結(jié)構(gòu)上可以是單細胞的或多細胞的；在繁殖習(xí)性上可以是有性生殖或無性繁殖；在生態(tài)系統(tǒng)中所承擔的功能可以是生產(chǎn)者、消費者或分解者。這些差別都應(yīng)在選擇監(jiān)測指標時予以考慮。例如，可以選用動物監(jiān)測具有神經(jīng)毒性作用的污染物。又如，可用蚯蚓吞食土壤腐敗有機質(zhì)的習(xí)性監(jiān)測土壤金屬污染，等等。